農(nóng)資連鎖經(jīng)營組織形式的發(fā)展深刻地反映了中國經(jīng)濟的變革，它從計劃經(jīng)濟時期以供銷社系統(tǒng)專營一統(tǒng)天下的局面，向市場經(jīng)濟過渡，轉(zhuǎn)成以個體經(jīng)營為主的分散經(jīng)營的格局。這種行業(yè)的劇變導(dǎo)致絕大部分企業(yè)或經(jīng)銷商在經(jīng)營中出現(xiàn)了很多致命的問題和隱患，導(dǎo)致經(jīng)營的失敗。
　　
　　一是相當(dāng)?shù)霓r(nóng)資企業(yè)或經(jīng)銷商根本不知連鎖經(jīng)營為何物，有的甚至認(rèn)為設(shè)計個形象，掛個門頭就已是連而鎖經(jīng)營。鏈不鎖，“掛羊頭，賣狗肉”現(xiàn)象在行業(yè)中十分盛行，認(rèn)識膚淺，缺乏長期持續(xù)經(jīng)營的理念。
　　
　　二是缺乏明確的戰(zhàn)略規(guī)劃：是進入批發(fā)環(huán)節(jié)，還是進入零售領(lǐng)域;只搞加盟，還是走直營連鎖之路;連鎖經(jīng)營的贏利模式是什么，是為了銷售本公司產(chǎn)品，還是打造商業(yè)平臺;是全國性開展還是區(qū)域性進行，是僅限于本行業(yè)，還是相關(guān)農(nóng)資產(chǎn)品都組合，將來是否上市等缺乏規(guī)劃。已開展農(nóng)資連鎖經(jīng)營的相當(dāng)是摸著石頭過河，走到那里算那里，錢花光了就關(guān)門。
　　
　　三是管理模式、管理手段與工具十分缺乏。連鎖經(jīng)營實行涉計人、財、物，店鋪區(qū)域分散，銷售戰(zhàn)線長，在人、財、物、信息管理等方面對企業(yè)都提出了很高的要求，必須有全新的管理模式和現(xiàn)代化的管理工具與手段。嚴(yán)格意義講，連鎖經(jīng)營的成功是管理工具的成功。
　　
　　四是農(nóng)資連鎖經(jīng)營企業(yè)人才嚴(yán)重缺乏。連鎖經(jīng)營的專業(yè)化十分強，需要既有高度責(zé)任心又懂經(jīng)營、懂專業(yè)、懂營銷及懂管理的店長等人才。
　　
　　五是連鎖內(nèi)部管理的精細化不足，農(nóng)資連鎖經(jīng)營要將農(nóng)資銷售與農(nóng)業(yè)技術(shù)推廣服務(wù)緊密地結(jié)合起來，通過有效的技術(shù)服務(wù)帶動農(nóng)資銷售。農(nóng)資連鎖店的人員培訓(xùn)、激勵與績效管理，產(chǎn)品、庫存、資金、客戶、信息等管理對連鎖企業(yè)又是一巨大門檻與挑戰(zhàn)。