1、抗生作用
抗生作用是指拈抗微生物通過產生代謝產物在低濃度下就能夠對病原微生物的生長和代謝產生抑制作用，從而來影響病原微生物的生存和活動。近半個世紀以來，人們從枯草芽孢桿菌不同菌株的代謝產物中分離純化了多種有效的抗菌物質。
2、溶菌作用
枯草芽孢桿菌的溶菌作用主要表現(xiàn)在是通過吸附在病原菌的菌絲上，并隨著菌絲生長而生長，而后產生溶菌物質造成原生質泄露使得菌絲體斷裂；或者是產生抗菌物質通過溶解病原菌孢子的細胞壁或細胞膜，致使細胞壁穿孔、畸形等現(xiàn)象從而抑制孢子萌發(fā)。
3、誘導植物產生抗性及促進植物生長
誘導植物產生抗性作用是指枯草芽孢桿菌不但能夠抑制植物病原菌，而且還能夠誘發(fā)植物自身抗病機制從而增強植物的抗病性能的作用。其中以枯草芽孢桿菌的抗逆性最強、功能最多、適應性最廣、效果最穩(wěn)定�？莶菅挎邨U菌能夠產生類似細胞分裂素、植物生長激素的物質，促進植物的生長使植物抵抗病原菌的侵害。
4、保護環(huán)境
枯草芽孢桿菌大量應用于生物肥料。當作用于作物或土壤時，能夠在作物根際或體內定殖，并起到特定肥料效應。
目前，微生物肥料在培肥地力，提高化肥利用率，抑制農作物對硝態(tài)氮、重金屬、農藥的吸收，凈化和修復土壤，降低農作物病害發(fā)生，促進農作物秸稈和城市垃圾的腐熟利用。提高農作物產品品質和食品安全等方面表現(xiàn)出了不可替代的作用。
土壤與其相連的水環(huán)境稱為土壤-水環(huán)境系統(tǒng)，其中存在著大量的土壤固有微生物，并在表面存在生物膜，因為生物膜形成了隔離層，有機污染物在接觸到支撐生物膜的固體基底之前，必須首先到達并且穿過這個隔離層，這樣就強烈地改變礦物顆粒或基底的吸附行為，對吸附作用有重要的影響。
近年的研究表明，由于受污染影響，導致土壤中含有多環(huán)芳烴（PAHs），沉積物中PAHs主要為原油污染以及工業(yè)或民用煤不完全燃燒所致，枯草芽孢桿菌對菲與苯并芘的吸附及生物降解研究。
6、枯草芽孢桿菌對土壤微生物的呼吸強度的影響
土壤呼吸強度作為土壤生物活性指標之一，能夠在一定程度上反應土壤營養(yǎng)物的轉化和供應能力，其呼吸速率變化及變化方向也反應了生態(tài)系統(tǒng)對脅迫的敏感程度和響應模式，是環(huán)境安全評價的一項重要指標，當土壤受到外來污染物污染時，微生物為了維持生存可能需要更多的能量，而使土壤微生物的代謝活性發(fā)生不同程度的響應。
研究表明各質量分數(shù)處理的枯草芽孢桿菌均表現(xiàn)為對土壤呼吸作用的刺激效應，并且土壤中枯草芽孢桿菌質量分數(shù)越大，對土壤呼吸強度的刺激作用越大，即刺激強度和施藥質量分數(shù)呈正相關。
7、枯草芽孢桿菌對土壤脲酶活性的影響
應用土壤酶作為監(jiān)測指標，評價農藥的生態(tài)毒理效應已成為環(huán)境科學領域的研究熱點之一。而脲酶屬于土壤中研究得比較深入的一種水解酶類，是唯一對尿素在土壤中轉化及尿素利用率有重大影響的酶。
尿素施人土壤后，在脲酶的催化作用下，迅速分解成二氧化碳和氨，所以土壤脲酶活性的降低，不僅可使尿素水解減緩，令其水解產物更多地被土壤吸附而有效減少尿素水解產物氨的揮發(fā)損失，也可能相應減少水解產物NH硝化作用潛勢。
研究表明所有處理用枯草芽孢桿菌處理過的土壤對土壤脲酶均表現(xiàn)出刺激效應。
枯草芽孢桿菌對脲酶刺激的機理，為微生物的生長提供了碳源和營養(yǎng)，從而使產生該種酶的微生物數(shù)量增長，活性增強，因而土壤中脲酶的活性也相應增強。
8、枯草芽孢桿菌對鹽堿地的改良
土壤內鹽分積累的危害：土壤結構黏滯，通氣性差，容重高，土溫上升，好氣性微生物活動差，養(yǎng)分釋放慢，滲透系數(shù)低，毛細作用強等，導致表層土壤鹽漬化進一步加劇，造成土壤冷、硬、板現(xiàn)象。枯草芽孢桿菌對鹽分有一定的降解作用。
選擇耐鹽的巨大芽孢桿菌和枯草芽孢桿菌優(yōu)勢菌株，生產出生物有機肥，用于植物生產，在投入成本相同的情況下，植物生長發(fā)育良好，產量增加，而且鹽堿地土壤理化性狀得到改善，土壤微生物數(shù)量增多。
此外由于枯草芽孢桿菌無致病性， 并可以分泌多種酶和抗生素， 而且還具有良好的發(fā)酵基礎，所以用途十分廣泛。
