這些替代方法包括了化學(xué)測(cè)試(in chemico)、體外測(cè)試(in vitro)和計(jì)算機(jī)模擬(in silico),并可應(yīng)用于皮膚致敏、皮膚刺激/腐蝕、基因毒性等毒性節(jié)點(diǎn)方面。
但是在不少替代方法的實(shí)際使用過程中,受限于單個(gè)方法本身的局限性,通常需要采用多組替代方法并結(jié)合專家評(píng)價(jià)的方式得出最終的結(jié)論以用于法規(guī)需求。
為了提高替代方法在化學(xué)品法規(guī)應(yīng)用方面的適用性與規(guī)范性,經(jīng)濟(jì)合作與發(fā)展組織(OECD)于2021年7月首次發(fā)布了一類限定方法(Defined Approach, DA)來用于評(píng)價(jià)化學(xué)品的皮膚致敏性。
該方法被采納為OECD TG 497,主要基于皮膚致敏的有害結(jié)局(Adverse Outcome Pathway, AOP)框架,通過限定的幾組替代方法采用規(guī)范化流程來完成對(duì)目標(biāo)化合物評(píng)估致敏性的評(píng)價(jià)。
有害結(jié)局路徑與皮膚致敏作用機(jī)制
有害結(jié)局路徑 AOP 最核心的內(nèi)容在于規(guī)范化和模塊化了從分子、細(xì)胞、組織、器官及至最終個(gè)體與群體水平的一系列毒性發(fā)生事件,并強(qiáng)調(diào)以邏輯推理性來確定這些毒性發(fā)生事件的前后關(guān)系。
在AOP框架中,毒性事件可以具體分為分子起始事件(Molecular Initiating Event, MIE; 在OECD指南中也被定義為Key Event 1, KE1),關(guān)鍵事件(Key Events, KEs)和有害結(jié)局(Adverse Outcome, AO)這三大類,而各個(gè)過程則是通過關(guān)鍵事件關(guān)系(Key Event Relationships, KERs)進(jìn)行連接。
簡單地來說,皮膚致敏事件可以理解為由一個(gè)分子起始事件開始,從而導(dǎo)致多個(gè)關(guān)鍵事件的發(fā)生,最后終結(jié)于“過敏性接觸性皮炎”這一有害效應(yīng)的過程。
皮膚致敏限定方法的開發(fā)即是建立于皮膚致敏的AOP框架之中(AOP ID: 40; OECD Project: 1.1),皮膚致敏過程分為誘導(dǎo)階段和隨后的免疫反應(yīng)激發(fā)階段。
❖ 第一個(gè)階段主要的分子起始事件(MIE, 即KE1)為外源物質(zhì)與皮膚蛋白的共價(jià)結(jié)合,形成半抗原。
❖ 隨后觸發(fā)了兩個(gè)細(xì)胞水平的關(guān)鍵事件(KEs),其中KE2為角質(zhì)細(xì)胞炎癥反應(yīng);KE3則是樹突狀細(xì)胞的激活。
❖ 第三個(gè)關(guān)鍵事件(KE4)則發(fā)生在器官水平,其過程為KE3中經(jīng)活化的樹突狀細(xì)胞遷移至局部淋巴結(jié),并向初始型T細(xì)胞遞呈組織相容性復(fù)合物(MHC),從而導(dǎo)致記憶T細(xì)胞的增殖與分化。
❖ 而一旦此個(gè)體的皮膚再次接觸原外源化合物時(shí),則會(huì)進(jìn)入免疫反應(yīng)激發(fā)階段,最終造成有害結(jié)局(AO):過敏性接觸性皮炎的發(fā)生。

皮膚致敏的AOP框架

皮膚致敏過程的誘導(dǎo)階段

皮膚致敏過程的激發(fā)階段
與關(guān)鍵事件相關(guān)的皮膚致敏試驗(yàn)方法
基于已建立的皮膚致敏的AOP框架,截止到目前針對(duì)于KEs已經(jīng)有開發(fā)了一系列測(cè)試方法,且部分已被OECD測(cè)試指南收錄為標(biāo)準(zhǔn)方法。針對(duì)這部分被OECD測(cè)試指南收錄的方法總結(jié)如下:

限定方法與整合測(cè)試和評(píng)估方法
雖然基于皮膚致敏AOP框架已開發(fā)了上述一系列的體外測(cè)試方法,但由于皮膚致敏反應(yīng)機(jī)制涉及多因素、多水平的復(fù)雜分子生物學(xué)過程,因此單一的體外測(cè)試方法并不能保障對(duì)目標(biāo)化合物的皮膚致敏性有足夠的預(yù)測(cè)能力。
基于這一原因,皮膚致敏整合測(cè)試和評(píng)估方法(IATA)應(yīng)運(yùn)而生。
具體而言,IATA運(yùn)用了多組體外測(cè)試結(jié)果并結(jié)合了專家評(píng)價(jià)來綜合判斷目標(biāo)化合物是否具有皮膚致敏性,但顯而易見的是這種方式并不能完全適用于法規(guī)需求中的決策目的,最主要的影響條件在于不同專家評(píng)價(jià)結(jié)果可能會(huì)導(dǎo)致開放性的結(jié)論,造成無法對(duì)目標(biāo)化合物的皮膚致敏性評(píng)估達(dá)成統(tǒng)一性判斷。
為了讓替代方法更能夠滿足法規(guī)需要,逐漸發(fā)展而來的限定方法(Defined Approach, DA)與IATA最大的差異在于不再依賴專家評(píng)價(jià),僅采用限定的幾組體外試驗(yàn)結(jié)果,即可對(duì)目標(biāo)化合物完成致敏性評(píng)估。
除此之外,通過按規(guī)定流程結(jié)合(Q)SAR預(yù)測(cè)的方式,DA也能夠進(jìn)一步得出法規(guī)所需的統(tǒng)一危害分類結(jié)果。
皮膚致敏限定方法OECD TG 497的評(píng)估流程
在OECD TG 497中,皮膚致敏性的限定方法主要有如下3種:
01 從一組in chemico 試驗(yàn)(KE1, OECD TG 442C: DPRA)和兩組in vitro 試驗(yàn)(KE2, OECD TG 442D: KeratinoSensTM ; KE3, OECD TG 442E: h-CLAT)中采用“3選2(2o31)”的限定方法對(duì)目標(biāo)化合物的皮膚致敏性進(jìn)行危害識(shí)別。
02 通過采用一組in chemico試驗(yàn)(KE1, OECD TG 442C: DPRA)、一組in vitro試驗(yàn)(KE3, OECD TG 442E: h-CLAT)與一組in silico方法(Derek Nexus)的結(jié)果形成整合測(cè)試策略(ITSv12),基于EG DASS3專家組發(fā)展而來的數(shù)據(jù)解釋步驟(DIP4)來對(duì)目標(biāo)化合物的皮膚致敏性得出UN GHS危害分類結(jié)論。
03 通過采用一組in chemico試驗(yàn)(KE1, OECD TG 442C: DPRA)、一組in vitro試驗(yàn)(KE3, OECD TG 442E: h-CLAT)與一組in silico方法(OECD QSAR Toolbox)的結(jié)果形成整合測(cè)試策略(ITSv22),基于EG DASS3專家組發(fā)展而來的數(shù)據(jù)解釋步驟(DIP4)來對(duì)目標(biāo)化合物的皮膚致敏性得出UN GHS危害分類結(jié)論。
1 2o3: 3選2(2 out of 3)
2 ITSv1或ITSv2: 整合測(cè)試策略v1或v2(integrated testing strategy version 1 or version 2)
3 EG DASS: 皮膚致敏限定方法開發(fā)專家組(Expert Group on Defined Approaches for Skin Sensitisation)
4 DIP: 數(shù)據(jù)解釋步驟
(Data interpretation procedure)

2o3皮膚致敏限定方法的決策樹

ITSv1/ITSv2皮膚致敏限定方法的決策樹
皮膚致敏限定方法的性能評(píng)估
雖然受限于數(shù)據(jù)集的大小,但在OECD TG 497中也盡可能地評(píng)估了三種限定方法對(duì)皮膚致敏的預(yù)測(cè)性能(如下圖所示)。
可以發(fā)現(xiàn)的是當(dāng)前這三種限定方法已在準(zhǔn)確度(Balanced Accuracy, BA)、靈敏度(Sensitivity, Sens)和特異性(Specificity, Spec)方面均基本能滿足法規(guī)需求,且與IATA相比也不再需要額外的專家評(píng)價(jià),因此該限定方法的開發(fā)極大提升了替代方法應(yīng)用于皮膚致敏評(píng)估時(shí)的適用性與規(guī)范性。
但仍需要注意的是這些限定方法仍受限于具體的替代方法本身(如DPRA, KeratinoSensTM和h-CLAT對(duì)于Log P > 3.5的目標(biāo)化合物預(yù)測(cè)靈敏度較低;金屬化合物不適用于DPRA試驗(yàn)等),以及當(dāng)出現(xiàn)不明確的結(jié)論時(shí)還需要進(jìn)一步的分析策略。

三種限定方法與LLNA方法在預(yù)測(cè)OECD標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)致敏性的表現(xiàn)
隨著替代方法成為化學(xué)品安全性評(píng)價(jià)中發(fā)展的新趨勢(shì),瑞歐科技也立足技術(shù)演進(jìn),積極布局替代方法在化學(xué)品、化妝品、農(nóng)藥、藥品等方面的應(yīng)用,綜合運(yùn)用計(jì)算化學(xué)、(Q)SAR、體外試驗(yàn)等解決皮膚致敏、皮膚刺激/腐蝕、基因毒性等評(píng)估中所面對(duì)的實(shí)際問題。
對(duì)于非測(cè)試方法,瑞歐科技可為客戶提供多達(dá)十幾種(Q)SAR軟件預(yù)測(cè)與專家評(píng)估服務(wù)。
同時(shí),為了進(jìn)一步提高預(yù)測(cè)結(jié)果的有效性和可靠性,瑞歐科技也于近期與全球知名的信息平臺(tái)Lhasa開展正式合作,將領(lǐng)先的(Q)SAR預(yù)測(cè)系統(tǒng)Derek Nexus & Sarah Nexus納入為客戶提供服務(wù)的軟件工具中。
在限定方法OECD TG 497中,整合測(cè)試策略(ITSv1)的in silico方法使用的即是Derek Nexus v6.1.0。
在2020年約翰霍普金斯動(dòng)物試驗(yàn)替代中心主導(dǎo)開展的一項(xiàng)針對(duì)皮膚致敏性節(jié)點(diǎn)的計(jì)算機(jī)模擬方法評(píng)估的研究中,Derek Nexus在Basketter數(shù)據(jù)集和HSDB數(shù)據(jù)集中均表現(xiàn)出了良好的適用性和準(zhǔn)確度。

Derek Nexus介紹 - 規(guī)則模型(Rule-based models)
Derek Nexus介紹 - 規(guī)則模型(Rule-based models)
Derek Nexus被藥品監(jiān)管機(jī)構(gòu)FDA、EMA和NMPA所廣泛采用,也是歐盟化學(xué)品評(píng)估、歐盟和其他國家(巴西、澳大利亞等)農(nóng)藥等同性評(píng)估中所推薦的 (Q)SAR軟件預(yù)測(cè)系統(tǒng)。特點(diǎn):
- 基于毒理學(xué)專家數(shù)十年的經(jīng)驗(yàn)積累
- 涵蓋數(shù)百種結(jié)構(gòu)警報(bào),并對(duì)難預(yù)測(cè)的毒性結(jié)構(gòu)如芳香胺等充分優(yōu)化
- 廣泛的毒理學(xué)節(jié)點(diǎn):基因毒性、皮膚致敏性(限定方法DA、定量EC3預(yù)測(cè)、無致敏性預(yù)測(cè))、致癌性、生殖/發(fā)育毒性、神經(jīng)毒性等
- 高度透明,所有毒理學(xué)評(píng)估依據(jù)、文獻(xiàn)來源均可獲取

Sarah Nexus介紹 - 統(tǒng)計(jì)模型(statistic-based models)
Sarah Nexus基于一種新穎的層次聚類模型SOHN方法來自學(xué)習(xí)訓(xùn)練集中的碎片化分子結(jié)構(gòu),通過這種機(jī)器學(xué)習(xí)方法從而靈敏的識(shí)別目標(biāo)分子中與基因毒性相關(guān)的結(jié)構(gòu)特征。
特點(diǎn):
- 高靈敏度的預(yù)測(cè)方法,與Derek Nexus配合使用能極大提高預(yù)測(cè)的有效性與可靠性
- 基于可靠、海量的Ames致突變?cè)囼?yàn)數(shù)據(jù)
- 訓(xùn)練集通過了充分的可靠性驗(yàn)證,能夠提供可信的數(shù)據(jù)來源
- 高度透明,具有完備的推理過程